Le secrétariat général joue un rôle central et crucial au sein du BEARIC. Il garantit la cohérence, l’efficacité et l’impact des projets sur le terrain en assurant l’alignement des activités avec la mission globale de l’organisation et les exigences des bailleurs de fonds. Il identifie les bailleurs de fonds potentiels, conçoit et rédige les propositions de projets, et négocie les subventions. Il est également chargé de la reddition de comptes et du respect strict des procédures financières exigées. C’est l’organe exécutif du BEARIC.
Pour bien exercer son rôle, le Secrétariat Général est constitué par deux grands département notamment celle de la Gestion de l’Administration et finances ainsi que le programme. Les deux départements sont composés à leur tour par d’autre sous départements.